IDENTIFIKASI FARMAKOFOR

Farmakofor dapatdiidentifikasi dari suatu sel ligan yang telah diamati untuk berinteraksi denganreseptor sasaran. Sebuah farmakofor didefinisikan sebagai susunan 3D fitur yang sangat penting untuk molekul ligan untuk berinteraksi dengan reseptor target dalam situs pengikatan tertentu. Setelah diidentifikasi, farmakofor dapat berfungsi sebagai model penting untuk screening virtual, terutama dalamkasus dimana struktur 3D dari reseptor tidak diketahui dan teknik docking yang tidak berlaku.

 Identifikasi farmakofor

·        - Menentukan gugus-gugus penting yang dapat berikatan dengan reseptor

·         -Menentukan posisi relative 3D gugus-gugus molekul dengan target

·        - Bagaimana konformasi aktif dari molekul

·        - Penting sebagai dasar untuk merancang obat

·        - Penting sebagai dasar untuk penemuan obat baru

Ikatan umum farmakofor

Mendefinisikan posisi relatif di ruang interaksi ikatan penting yang diperlukan untuk aktivitas.

-Akseptor ikatan hidrogen

-Donor ikatan hidrogen

-interaksi van der Waals

-Interaksi ionik

  

Konformasi Aktif

 -Konformasi diadopsi oleh obat saat mengikat targetnya

 -Identifikasi konformasi aktif diperlukan untuk mengidentifikasi farmakofor 3D

 -Analisis konformasional mengidentifikasi kemungkinan konformasi dan stabilitasnya

 -Analisis konformasional sulit bagi molekul fleksibel dengan sejumlah besar konformasi

 -Lebih mudah membandingkan aktivitas analog yang kaku

      

    Permasalahan

1 1.Bagaimana cara mengidentifikasi farmakofor?

   2.Bagaimana cara mendesign obat dari senyawa yang sudah diketahui kegunaan ny?

    

 Daftar Pustaka 

 Wermuth, C. G.; Ganellin, C. R.; Lindberg, P.; Mitscher, L. A. (1998-01-01). "Glossary of terms used in medicinal chemistry (IUPAC Recommendations 1998)". Pure and Applied Chemistry (dalam bahasa Inggris). 70 (5). doi:10.1351/pac199870051129. ISSN 1365-3075.

2.      Yang, Sheng-Yong. "Pharmacophore modeling and applications in drug discovery: challenges and recent advances". Drug Discovery Today. 15 (11-12): 444–450. doi:10.1016/j.drudis.2010.03.013.